«Агроекологічний журнал» є періодичним фаховим науково-теоретичним виданням, де висвітлюються актуальні проблеми екології, раціонального природокористування й охорони навколишнього природного середовища, агроекологічного моніторингу, родючості й охорони грунтів, біорізноманіття і біобезпеки екосистем тощо.

Засновниками «Агроекологічного журналу» є Інститут агроекології і природокористування Національної академії аграрних наук України, Державна установа «Інститут охорони ґрунтів України».